História da criação do modelo espacial
O famoso modelo da estrutura espacial do DNA foi proposto em 1953 pelo biólogo americano James Watson e pelo pesquisador britânico Francis Crick. A descoberta deles não surgiu do nada: os cientistas basearam-se em um rico conjunto de dados obtidos por seus colegas. Um papel crucial foi desempenhado pelos resultados da cristalografia de raios X realizada pelo biofísico Maurice Wilkins e pela cristalógrafa Rosalind Franklin.
O conceito proposto da dupla hélice foi um verdadeiro avanço na biologia molecular. Pela primeira vez, permitiu dar uma explicação química clara às propriedades biológicas mais importantes dos ácidos nucleicos: a capacidade de codificar informações genéticas e o processo de replicação (duplicação).
Principais disposições da organização da dupla hélice
A estrutura baseia-se em duas cadeias polinucleotídicas. O modelo de Watson e Crick descreve a forma $\beta$ clássica da molécula, caracterizada pelos seguintes princípios:
- Espiralização. Ambas as cadeias estão enroladas em uma dupla hélice ao redor de um único eixo central.
- Direção das voltas. A hélice é dextrógira. Se olharmos ao longo do eixo central da molécula, as rotações das cadeias seguem estritamente no sentido horário.
- Antiparalelismo. As fitas polinucleotídicas apontam emdireções opostas. Isso significa que a extremidade 5' de uma cadeia está disposta de forma espelhada em frente à extremidade 3' da segunda cadeia.
- Orientação dos nucleotídeos. Cada nucleotídeo individual está situado em um plano estritamente perpendicular ao eixo central da hélice.
- Presença de sulcos. Na estrutura tridimensional da molécula enrolada, distinguem-se claramente duas reentrâncias: o sulco maior e o sulco menor.
Complementaridade e pontes de hidrogênio
As duas cadeias antiparalelas estão firmemente unidas entre si por pontes de hidrogênio. Essas ligações não ocorrem de forma caótica, mas estritamente entre as bases nitrogenadas pertencentes a cadeias diferentes. A interação das bases possui altíssima especificidade e obedece ao princípio da complementaridade.
Bases físico-químicas do emparelhamento:
- Pares A=T (adenina e timina) formam exatamente duas pontes de hidrogênio entre si.
- Pares G≡C (guanina e citosina) ligam-se de forma mais forte — por meio de três pontes de hidrogênio.
Graças à estrita complementaridade, a sequência de nucleotídeos em uma cadeia determina inequivocamente a sequência na segunda. Essa propriedade garante a função molde do DNA: ao desenrolar a hélice, cada cadeia isolada atua como um molde pronto no qual uma nova cadeia, totalmente complementar a ela, é sintetizada.
Parâmetros métricos da molécula
A dupla hélice possui características geométricas estritas e inalteradas. O estudo da estrutura permitiu deduzir os seguintes parâmetros métricos:
- Distância entre nucleotídeos adjacentes: é de 0,34 nm.
- Uma volta completa da hélice: é igual a 3,4 nm. Ao longo de uma volta, acomodam-se exatamente 10 nucleotídeos.
- Diâmetro da molécula: é estavelmente igual a 2 nm em toda a sua extensão.
Uma consequência interessante da estrutura química: regiões de DNA ricas em pares A=T são significativamente mais fáceis de ter suas cadeias separadas (processo de desnaturação). Como duas pontes de hidrogênio são mais fáceis de romper do que três, essas regiões ricas em A=T servem, na maioria dos casos, como pontos de início da replicação (origins of replication).
Resumo: perguntas e respostas sobre o tema
Por meio de quais ligações químicas os nucleotídeos estão unidos dentro de uma única cadeia polinucleotídica de DNA?
Os nucleotídeos dentro de uma única cadeia polinucleotídica de DNA estão conectados por ligações fosfodiéster covalentes. Essas ligações formam o esqueleto ( arcabouço) açúcar-fosfato da cadeia polinucleotídica, que consiste em resíduos alternados de desoxirribose e fosfatos, localizado na parte externa da dupla hélice.
Mecanismo de formação do esqueleto:
- Ligação fosfodiéster — o grupo fosfato no átomo de carbono na posição $5'$ de um anel conecta-se ao átomo de carbono na posição $3'$ do anel pentose seguinte.
Graças a esse mecanismo, a cadeia adquire polaridade: a extremidade $5'$ possui um grupo fosfato livre, enquanto a extremidade $3'$ termina com um grupo hidroxila livre ($3'$-OH).
Quais bases nitrogenadas do DNA pertencem às púricas e quais pertencem às pirimídicas?
As bases nitrogenadas na molécula de DNA são representadas por compostos heterocíclicos e dividem-se em púricas e pirimídicas.
- Bases púricas — possuem uma estrutura de dois anéis (um hexagonal e um pentagonal). No DNA, incluem a adenina (A) e a guanina (G).
- Bases pirimídicas — possuem uma estrutura química de um único anel hexagonal. Na molécula de DNA, incluem a citosina (C) e a timina (T).
As bases pirimídicas também incluem a uracila (U), no entanto, ela é encontrada apenas na composição do RNA, enquanto a timina é o seu análogo metilado e é característica do DNA.
Questões de aulas e exames
O que significa a antiparalelidade das fitas de DNA?
É o princípio de organização espacial em que duas fitas polinucleotídicas correm em direções opostas. Como resultado, a extremidade 5' de uma fita corresponde sempre à extremidade 3' da outra.
Em que direção a hélice está enrolada?
A forma beta clássica da molécula é dextrógira. Ao olhar ao longo de seu eixo, as rotações da cadeia ocorrem no sentido horário.
Por que os pontos de início da replicação são frequentemente enriquecidos em pares A=T?
Os pares adenina-timina são mantidos unidos por apenas duas pontes de hidrogênio (enquanto os pares guanina-citosina por três). Regiões com predomínio de A=T são mais fracamente ligadas e sofrem desnaturação (desenrolamento) mais facilmente, o que é necessário para o início da replicação.
Quantos nucleotídeos contém uma volta da hélice?
Uma volta completa da hélice tem um comprimento de 3,4 nm e contém exatamente 10 nucleotídeos. A distância entre nucleotídeos adjacentes é, portanto, de 0,34 nm.
O que mais estudar sobre o tema
- Função molde e mecanismos de replicação do DNA
- Processo de desnaturação e separação das cadeias polinucleotídicas
- O papel dos sulcos maior e menor no funcionamento do DNA
- Métodos de cristalografia de raios X para ácidos nucleicos
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