“大进化”板块致力于研究导致大型系统分类单元（属、科、纲和门）形成的宏观历史进程。与微进化不同，这些变化历经数百万年，但正是它们决定了生物圈的现代面貌。
在本单元中，我们分析三个核心主题。物种形成解释了从单一居群中产生新的、生殖隔离的物种的机制。大进化揭示了生命发展的一般规律和方向（广布性演化/芳生演化、趋同/狭布性演化、普遍退化）。系统发生有助于重建生物的历史亲缘关系并构建其进化树。
在医学院校的课堂和考试中，最常考查的是物种形成的途径（异域物种形成和同域物种形成），并会要求举出脊椎动物芳生演化的例子。请特别注意系统发生的规律——这是理解人类比较解剖学与胚胎学以及先天性畸形发生机制的基础。