Cette section est consacrée à l'étude des virus à ARN à l'origine des épidémies les plus marquantes de notre époque. Bien que la section soit intitulée « Coronavirus », la logique d'étude des infections zoonotiques à fort potentiel pandémique impose d'y aborder également les agents des fièvres hémorragiques hautement dangereuses : les virus Ebola et Marburg (famille des Filoviridae).
La section propose une analyse détaillée de la structure des virions, des facteurs de pathogénie et de l'épidémiologie. Vous y suivrez l'évolution des coronavirus, passés du statut d'agents de rhumes bénins à ceux, mortels, du SRAS, du MERS et du SARS-CoV-2. Un module spécifique est consacré à la manière dont les filoviridae pénètrent dans les macrophages et l'endothélium, provoquant des hémorragies systémiques et un choc.
Lors des travaux pratiques et des examens, les enseignants adorent interroger sur les mécanismes de développement de la « tempête de cytokines », la spécificité réceptrice des coronavirus (notamment l'affinité pour l'ACE2) et les algorithmes de diagnostic de laboratoire. Portez une attention particulière aux questions de biosécurité : les manipulations des virus Ebola et Marburg s'effectuent exclusivement dans des laboratoires de niveau de confinement maximal (BSL-4).